在21世纪新型军事作战方式下，现代海战已经没有多少高空目标可以攻击，反舰导弹射程的增加使敌方攻击机在舰队防空导弹射程之外就可以完成导弹的发射，区域防空导弹面临的不是远离编队火力范围的飞机就是低空突防的导弹。在这种环境下，如果与具备一定空中作战能力的国家对抗时，为高空飞行目标而设计的海红旗-9在拦截低空掠海飞行的反舰导弹为主的海上防空作战中效果有限。

　　从二战到现在的海战史已经表明，在实力差距不大的情况下，水面舰艇从来就没有依靠舰载防空火力成功阻止过航空兵突击的战例。防空武器全面导弹化的英国皇家海军舰队在80年代仍然没有阻止阿根廷航空兵的突击，如果没有航空兵的掩护，舰队仅靠防空导弹无法完全保证自身安全。单纯看技术指标可以认为海红旗-9并不能有效的保护舰队安全。即使是俄罗斯也不再改进SA-N-6，而是在中近程的SA-N-12基础上研制通用化的导弹系统。

　　不过在现阶段，人民海军无法拥有舰载战斗机保护（即航空母舰）的无奈情况下，海红旗-9仍然是人民海军现阶段不可或缺的防空利器。以上的描述只是让读者明白：海红旗-9这样的中远程防空导弹并不是未来舰载防空导弹的主流方向。中近程的海红旗-16的研制与服役正是说明了这一点。